AnyToISO kann ISO-Images aus Dateien und Ordnern, die sich auf Ihrem lokalen Laufwerk befinden, erzeugen. Hierfür sollte man einen Ordner haben, der alle Dateien/Ordner für das gewünschte ISO enthält. Wählen Sie dann den Ordner in der App unter dem Tab 'Folder to ISO' aus (in Windows kann man dies einfach über Rechtsklicken des Ordners im Explorer erreichen). Es wird empfohlen, die gewünschte Volume-Bezeichnung zu wählen. Das endgültige ISO-Image ist mit Windows/MacOS/Linux kompatibel und kann mit jedem Programm, das ISO-Images unterstützt, gelesen werden. Natürlich kann es auf ein optisches Medium wie CD/DVD/Blue-ray gebrannt werden.
Standard-Dateisysteme sind ISO 9660, Joliet (ISO 9660 Erweiterung unterstützt Kleinbuchstaben und längere Dateinamen) und UDF. Die Konfiguration der Dateisysteme und ihrer Parameter kann in einem speziellen Dialog ausgeführt werden, nachdem man auf die Einstellungen klickt.